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帕金森氏症(Parkinson's Disease)是一种神经退化的疾病，临床上可能出现的症状主要以静态颤抖、肌肉关节僵硬、行动迟缓及小碎步走路等为主。

而在带有LRRK2基因突变的人当中，帕金森氏症患者血浆中咖啡因的浓度比未患病的人低76％，而带有LRRK2突变基因，且患有帕金森氏症的人也较少在饮食中摄取咖啡因，他们比未患病的人（无论是否带有突变的LRRK2基因）每天少摄取了41％咖啡因。

经代谢组学分析血浆中200多种代谢产物后，发现患帕金森氏症的患者除了在血浆中咖啡因含量较低之外，咖啡因的代谢物，如咖啡因的去甲基化代谢产物、葫芦巴硷(trigonelline)、黄嘌呤、茶硷、1-甲基黄嘌呤和曲古硷等化学物质的含量则较高。

除此之外，研究人员也发现，和LRRK基因突变但却没有患病的组别来比，患帕金森氏症者的脑脊髓液中，咖啡因和其相关代谢物的含量也较低。

咖啡因阻断高度表达帕金森氏症的受体　保护神经降低发病的风险

带有LRRK2基因突变的人，往往脑中的A2a受体会高度表达，而A2a受体位于抑制性神经元上，神经传导物质与A2a受体结合时，会更加抑制下游神经元的活性。由于咖啡因的结构与原本的神经传导物质相似，当摄取咖啡因之后，可能可以因为与A2a受体结合，减缓A2a过度表达的情形，进而能够有保护神经的作用，进而帮助降低发病的风险。