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帕金森氏症(Parkinson's Disease)是一種神經退化的疾病，臨床上可能出現的症狀主要以靜態顫抖、肌肉關節僵硬、行動遲緩及小碎步走路等為主。

而在帶有LRRK2基因突變的人當中，帕金森氏症患者血漿中咖啡因的濃度比未患病的人低76％，而帶有LRRK2突變基因，且患有帕金森氏症的人也較少在飲食中攝取咖啡因，他們比未患病的人（無論是否帶有突變的LRRK2基因）每天少攝取了41％咖啡因。

經代謝組學分析血漿中200多種代謝產物後，發現患帕金森氏症的患者除了在血漿中咖啡因含量較低之外，咖啡因的代謝物，如咖啡因的去甲基化代謝產物、葫蘆巴鹼(trigonelline)、黃嘌呤、茶鹼、1-甲基黃嘌呤和曲古鹼等化學物質的含量則較高。

除此之外，研究人員也發現，和LRRK基因突變但卻沒有患病的組別來比，患帕金森氏症者的腦脊髓液中，咖啡因和其相關代謝物的含量也較低。

咖啡因阻斷高度表達帕金森氏症的受體　保護神經降低發病的風險

帶有LRRK2基因突變的人，往往腦中的A2a受體會高度表達，而A2a受體位於抑制性神經元上，神經傳導物質與A2a受體結合時，會更加抑制下游神經元的活性。由於咖啡因的結構與原本的神經傳導物質相似，當攝取咖啡因之後，可能可以因為與A2a受體結合，減緩A2a過度表達的情形，進而能夠有保護神經的作用，進而幫助降低發病的風險。