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當影響大腦的中樞神經時，帶來的健康問題包括憂鬱、睡眠、認知能力、記憶力、情緒，若更嚴重則導致自閉症、妥瑞症、巴金森氏症、失智症等。

馬尚榮藥師表示，腸道菌也會透過腦腸軸影響大腦，進而影響到全身器官組織，心臟、肝臟、肺臟、腎臟、皮膚、骨骼等等，影響極廣。當影響大腦的中樞神經時，帶來的健康問題包括憂鬱、睡眠、認知能力、記憶力、情緒，若更嚴重則導致自閉症、妥瑞症、巴金森氏症、失智症等。

除了以上的遠端影響，腸道菌失衡最直接的影響就是便祕、消化不良、腸躁症、大腸發炎等腸道疾病，還有影響快樂賀爾蒙（血清素、多巴胺）的濃度，對情緒的影響更是直接。

馬尚榮藥師表示，要維護「腸腦軸線」平衡，就必需先從改善腸道菌叢生態做起，可以透過以下2個方式：

1.攝取益生菌

有益人體腸道健康的活菌，可改善腸內微生態平衡、預防腸道疾病。

2.攝取益菌生(又稱益生元)

是益生菌的食物，「益菌生」物質能夠被人體腸胃的「益生菌」利用，而產生有機酸，刺激腸蠕動，讓腸道保持酸性狀態，使喜愛鹼性環境的壞菌，不易生存繁殖。因而促進「益生菌」的生長，抑制壞菌數量，提升腸道好菌數目，維護腸道健康。常見的益菌生包含一些不易為人體消化的碳水化合物，如：膳食纖維、木寡糖、果寡糖，以及益生菌的發酵產物等成分。