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正念冥想有佛教和医学两大根基，理念和手法奠基于佛教流传的佛陀冥想，以及以各种冥想为基础所开发的医学性疗程。

佛教基础

佛教教义中的佛陀冥想广泛流传。经由印度到中国，甚至传到了日本。正念疗法基本上沿用了佛教的教义和术语。

医学基础

佛教的冥想经由印度和斯里兰卡，一直传达到了欧美。麻萨诸塞大学的乔恩 卡巴特 津恩博士以佛教冥想为基础，创建了医学性的疗程。此后正念冥想的效果才广泛扩及全球。

佛教的冥想传统和由此发扬光大的医学疗程互相影响，构成了现代的正念疗法。

根源于佛教冥想

佛教的创始者佛陀在各式各样冥想的过程中，获得了开悟，随后又将他的经验传给了后世。佛陀的冥想可以使心灵开放，从烦恼中解脱。这就是正念冥想的骨干。

美国的医学性疗程

由于佛陀的冥想能够整备心灵，在世界各地和各个领域都有人在运用。美国将其中的一部分引入医学界，将正念疗法作为解除压力的方法。冥想虽然已经不同于原先的面貌，但是也更加贴近生活所需。此外，人们也从佛教和医学双方的观点进行综合性的研究。