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两者重视的地方不同

佛教基础和医学，两者使用正念冥想的目的并不相同。佛教主张“无我”“醒悟”的教义，医学则着重减轻压力和治疗疾病。

医学上的正念冥想

以研究为基础所建构的制式疗法。卡巴特金恩博士的方法中，目标是在八周内降低压力。另外还有十二周的疗程，无论何者都以改善实践者的健康状态为目的。

佛教中的正念冥想

遵从佛陀的教义，透过冥想来到达没有烦恼与痛苦的醒悟状态。基本上实践者只有佛教徒， 他们会建立目标，不划定明确的冥想周期，终身施行。

在佛教的寺庙，一开始会先聆听佛教徒的法语，之后会遵循佛陀的训示进行冥想。是一种宗教仪式的实践。

冥想也能消除抑郁与不安

针对忧郁等症状也有进一步研究。在医学的领域中，卡巴特金恩博士首先将冥想转变为缓和慢性疼痛的方法。效果获得实证以后，研究继而进一步发展，如今人们多以忧郁和不安等精神症状的治疗方法为方向展开研究。