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中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中表示，疫苗採購「重複投資」有必要。

第二，在專業面上面，陳時中指揮官強調，所有進入台灣的疫苗，都必須取得FDA的查驗、登記，確認其相關技術性資料，以及人體試驗的相關臨床報告，經確認無疑慮後才能開放進口。而關於此一疫苗運輸、保存上所需要的冷鏈技術上，東洋藥廠也準備來建廠，指揮中心也會積極協助。

台灣東洋藥廠出面澄清：BioNTech SE係一已上市之德國公司　並非陸資企業

針對外界有人提出有中資疑慮，台灣東洋藥廠已經於10月13日發文澄清：除了指揮中心說法外，台灣東洋藥廠也大動作出面澄清，強調台灣東洋藥廠所取得的COVID-19（武漢肺炎）疫苗授權之德國BioNTech SE（Nasdaq：BNTX,以下簡稱BNT）。

經查BNT係一註冊登記於德國，2019年10月於美國Nasdaq掛牌之新藥研發公司，依據公開資訊該公司前三大股東分別為AT Impf GmbH（持有50.20%）、Medine GmbH（持有18.80%）、Entities affiliated with MIG GmbH & Co.（持有6.11%），合計持有75.11%，其他股東則多為共同基金，而就公開資訊該公司之陸資僅占0.7%，離法令規範之30%甚遠。

另依BNT官網，該公司於2020年9月15日獲得德國政府資助歐元3億7,500萬元以加速新冠肺炎疫苗之開發，若BNT屬陸資企業，德國政府當無資助之理。且東洋藥廠也強調，此次獲授權代理的進口新冠肺炎疫苗之交易對象係BNT，相關疫苗之製造及其交易產生之金流、物流往來對象均在德國。