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若不是特別提到廣義的扁桃腺，一般所謂的扁桃腺是指肉眼可以看得到，位在口咽側壁、喉嚨深處的顎扁桃。

若不是特别提到广义的扁桃腺，一般所谓的扁桃腺是指肉眼可以看得到，位在口咽侧壁、喉咙深处的颚扁桃。医生用压舌板压住舌头，观察重点之一也是在看颚扁桃腺有没有变化，例如：有些病人，扁桃腺长了一些黄白色米粒状的东西，这可能是扁桃腺结石。

扁桃腺结石那里来的？

扁桃腺看起来凹凸不平，就像扁桃的果实，所以叫做扁桃腺。扁桃腺上面长了10~30个小洞，医学上叫为隐窝。为什么扁桃腺会长满这些小洞呢？由于扁桃腺是呼吸道和消化道的前哨站，是身体的安检系统，既然要辨识许多对人体不利的病原，与外界接触的面积当然愈广愈好。

所以这些小洞，里面都是深入扁桃腺的管道，这些管道的黏膜与扁桃腺上皮黏膜相连，大大增加了与外界环境的接触面积。血管、淋巴管、免疫细胞包围在这些隐窝管道的周围，重兵看守，一旦接触到病原体，便会启动人体的免疫机制，把它们消灭掉。

结石的原因，是由于隐窝的机能出现障碍，变成了病原体生长的温床，持续发炎产生的混合物会造成小洞阻塞，形成恶性循环。发炎导致阻塞，阻塞又加重发炎。结石的成份是由许多东西混合而成，刚开始可能是滋生在隐窝的细菌、死掉的免疫细胞或表皮细胞、混合一些黏液和食物残渣，积在隐窝里，慢慢就有会一些矿物质的沉积，例如碳酸钙、磷酸钙、镁盐、铵盐等等，最后硬化成像小石头的样子。