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超音波检查已经成为现代医疗的重要工具，其方便性、快速且非侵入性的特点，被广泛运用在各种疾病的诊断及治疗。新生儿检查中，自费超音波筛检可分为脑部、心脏、腹部及肾脏，以及髋关节等项目。

台北医学大学附设医院新生儿暨儿童加护病房主任苏一宇提到，新生儿超音波筛检依据检查目的，适合做的时间点各有不同，同时也提醒，无症状的健康足月新生儿进行这些检查，是否能够增加发现严重疾病的机会仍存疑，爸妈可依据自身需求选择合适的超音波项目。常见的超音波项目说明如下：

脑部超音波

由于新生儿的囟门尚未关闭，透过超音波可以看清楚大部分的脑部组织，对于有神经学症状、脑部缺氧、易发生脑室出血、白质软化等并发症的早产儿，脑部超音波就是很重要的筛检工具。

心脏超音波

先天性心脏病是新生儿最常见的异常疾病，有些疾病可能无法透过听诊或是观察血氧浓度得知，心脏超音波可看清楚新生儿心脏构造，为诊断的最佳工具。但现今许多先进医疗国家有完善的产前超音波检查、产后的身体理学检查，以及危急型先天性心脏病的筛检等重重把关，在以上检查皆正常的新生儿，爸妈可与医师讨论后再决定是否要加做。