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研究团队选择接受手术治疗为评估疗效的差距，因为在台湾大多数患者还是希望先接受非侵入性的治疗方式，只有真正痛到无法忍受、或是有怀孕压力才会考虑接受手术治疗，因此手术率可以作为衡量子宫内膜异位症治疗成效的间接指标，治疗效果越好则需要手术介入的必要性就越低，手术率也会下降。

经过长时间的追踪显示，接受中医治疗的子宫内膜异位患者，需要接受手术治疗的风险较低，在校正年龄、职业、分娩状态、痛经、缺铁性贫血等变项后，其风险比仍为 0.47 (0.42 - 0.53)。对于需要手术治疗的患者，中医治疗也显著延迟手术施行的时间，平均手术时间由1.6年延长到2.2年。

虽然研究中没有分析哪一种复方或单味药对于子宫内膜异位症最有效果，但整体而言接受中医治疗可以降低需要手术的风险，显示中医治疗具有一定程度的效果。

另一个研究是奥地利维也纳的Katharina Rubi-Klein医生，于2010年发表在《The European Journal of Obstetrics & Gynecologyand Reproductive Biology》杂志，探讨针灸减缓子宫内膜异位症经痛的效果。总共招募了101位子宫内膜异位症患者，所有人都经过内视镜检查确诊，且经痛的视觉疼痛指数超过 5 分（跟最痛的满分十分相比至少超过一半）。

患者随机分派接受两种不同的针灸，一组是中医理论认为有效的穴道组合，另一组则刻意选取传统上认为跟经痛无关的穴道作为对照。