2 2021/4/23 上午 10:02:55

台大醫院攜手微軟推動COVID-19基因研究 助精準醫療再進化

(關鍵字: 基因 , 微軟 , 台大醫院 , COVID-19 , 新冠病毒

1萬8千名COVID-19患者基因資料插補與分析,成功縮短至僅僅5小時。(圖片提供/台大醫院)
1萬8千名COVID-19患者基因資料插補與分析,成功縮短至僅僅5小時。(圖片提供/台大醫院)

每個人的基因皆是世上獨一無二的組成,世界衛生組織研究顯示,多數重大疾病是由先天基因體質與後天生活環境交互作用之下累積而成的結果。透過基因檢測不僅可讓人們充分了解先天體質,也能預知罹患疾病的風險。目前數據中每人會有大約73萬個比較常見的基因變異位點,在基因採檢時常有部分基因位點缺漏的狀況發生,因此醫療團隊在透過 AI分析基因前,都需要花費至少數個月的時間,以機器學習方式預測遺失位點,補齊所有基因資料。

面對此次英國Bio Bank所提供50萬筆的人體生物樣本資料,台大醫院現有的傳統伺服器在運行數個月後仍停留於插補程序運算,遲遲無法進展至分析階段,因此去年九月開始與微軟Azure專業技術團隊合作。微軟全球黑帶專家-亞洲區HPC/AI解決方案副總經理馮立偉表示,面對現有研究環境在處理巨量資料的侷限性,微軟不僅頃注Azure HPC高速算力與技術團隊,更尋求R程式套件國外創辦者協助與Intel 技術合作,共同進行演算法的修正與優化,找出最佳雲端硬體規格及資料量大小切割方式,進行基因插補與分析,因此能在合規、安全的Azure雲端環境下,透過Azure HPC提升基因運算速度40倍以上,大幅縮短分析時間、推進研究進程並確保醫學資料安全。

1萬8千名COVID-19患者基因資料插補與分析,成功縮短至僅僅5小時

奠基在Azure HPC運算優勢上,原需耗費數個月的1萬8千名COVID-19患者基因資料插補與分析,成功縮短至僅僅5小時,雙方團隊更將原需要計算超過二年以上的50 萬筆基因,提前至四週內完成分析,下一步更預計將基因庫內每筆人體生物樣本近億個基因位點資料運算完畢,成為未來精準醫療的基礎。

微軟與台大醫院期望研究成果將可帶動多基因風險分數等評估方式的建立,協助罹病高風險族群提早預防與治療,更促進學術研究正向發展,並將人類基因研究拓展到更多醫療領域上,推進醫療產業研究歷程,實現以事前預防取代事後治療的目標,賦能全世界醫療組織守護全球人民健康。

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