一般来说,目前的检验流程为,一旦患者出现发烧等疑似感染MERS的症状,向当地保健所申报后,保健所提取检测样本,之后将其送至当地检测机构进行抽取核酸、分析DNA的第一次检测过程之外。与此同时,还需确认检测对象是否受到污染物质的影响;若第一次检测结果呈阳性,相关样本将被送到公立保健研究院进行第二次重新检测确认。整个过程至少需花费16小时左右的时间。
而第二次的检验过程中,为确保检测结果的准确性需要标记两种与病毒相关的基因,所以花费的时间比第一次更长。最重要的是,检验过程中若发生最初提取的样本所含的病毒量不充分的变数,则必须从头开始进行所有的检测,使得获悉结果的时间再度延长。

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