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在台灣，約有55%的肺腺癌病患帶有EGFR基因突變。

在肺癌肿瘤中，最常见的驱动基因突变就是“上皮细胞生长因子接受器（EGFR）”，因此目前肺癌肿瘤基因检测最主要的检查为肺腺癌EGFR的第18至21区的基因定序是否有基因突变。在台湾，约有55%的肺腺癌病患带有EGFR基因突变，一般第19区及21区基因突变的肺癌患者，对EGFR标靶治疗“Gefitinib/Iressa（艾瑞莎）或erlotinib/Tarceva（得舒缓）”的效果较好；反观第18及20区出现基因突变者，对于EGFR标靶疗效则较差。

若晚期肺腺癌没有EGFR基因突变，表示对EGFR标靶治疗没有效果，医生将建议病患使用传统的化学治疗，或合并放射性治疗。有时带有EGFR突变基因的肺腺癌在使用EGFR标靶治疗一段时间后，原来缩小的肺部肿瘤将再变大，或出现远程转移恶化，表示癌细胞对原先的EGFR标靶药物产生抗药性，此时医生将建议患者再做一次切片检查，以检测是否产生抗药性的EGFR突变基因（如：EGFR基因的第20区突变T790M），使得“艾瑞莎/得舒缓”无法发挥作用，医生将与病患讨论进一步更换标靶药物或改采化学治疗。

EGFR基因以外的驱动基因变异

除了EGFR基因以外，其他常见的驱动基因突变还包括：KRAS、MET、HER2、ROS、RET、BRAF等，这些驱动基因突变的比例相较不高，但陆续有针对这些驱动基因突变的标靶药物研发，期待未来能有效应用于临床治疗上。

最近，针对ALK基因错位者的标靶药物，已于台湾卫福部核准上市，由于目前台湾健保尚未给付，患者一个月的花费约25-30万元台币。若晚期肺腺癌没有EGFR基因突变，则可进行EML4-ALK基因重组检测。根据国外临床研究，针对肺腺癌EML4-ALK基因重组阳性患者，相对于化学治疗，标靶药物Crizotinib（XALKORI截克瘤）可显著降低肺癌恶化或减少死亡风险。