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肺炎链球菌疫苗可以根据“涵盖血清型价数”及“疫苗种类”来做区分，疫苗种类依照制造方式可分为多醣体疫苗（pneumococcal capsular polysaccharide vaccine, 简称PPV）与接合型疫苗（pneumococcal conjugated vaccine，简称PCV），两者皆为次单元疫苗（subunit vaccine），可与其他疫苗同时接种，但是因为制造的方式不同，导致疫苗的特性也有差异。

多醣体疫苗是将去活化的肺炎链球菌利用化学方式把荚膜多醣纯化出来当作疫苗中主要成分。PPV可以活化B淋巴细胞，但不会活化T淋巴细胞，所以诱导出来的免疫反应持续时间较短且无法产生免疫记忆，加上婴幼儿免疫力尚未发育成熟无法有效产生抗体，因此不适用于2岁以下幼童而主要适用于老年人。

23价PPV疫苗于1983年上市（涵盖1、2、3、4、5、6B、7F、8、9N、9B、10A、11A、12F、14、15B、17F、18C、19F、19A、20、22F、23F、33F血清型），临床试验显示PPV23预防菌血性肺炎的保护效果约可达50%，但是对主要的非菌血性肺炎的预防效果则不明显，并且也无法减低鼻咽部带菌的情况。因此PPV23虽然较PCV涵括了更多的血清型而可以补充PCV接种后的其他血清型免疫力，但因为保护期限短，需要重复接种而导致抗体产生反应下降进而造成免疫耐受性。因此对于高风险老年及幼儿的保护力较为不足。

为了改善肺炎链球菌多醣体疫苗的缺点，PCV将荚膜多醣体结合上蛋白质载体形成接合型疫苗，也就是把荚膜多醣体拿来先绑上一个蛋白质让人体的T淋巴细胞比较容易辨识，且帮助B淋巴细胞产生抗体，此种疫苗对免疫力尚未成熟的婴幼儿最有效果，能产生持久的免疫记忆。PCV可以使鼻咽部黏膜受到免疫的保护，使肺炎链球菌的带菌移生机率降低，进而减少肺炎链球菌的传播。目前已发展出7价、10 价与13 价 PCV（包含1、3、4、5、6A、6B、7F、9V、14、18C、19F、19A、23F血清型）。其中PCV7 及 PCV13 之内容物为肺炎链球菌荚膜多醣体结合CRM197蛋白载体形成，而PCV10则为荚膜多醣体结合protein D、diphtheria、tetanustoxoids蛋白载体形成。

只要没有对疫苗成份过敏，PCV13是较PPV23安全且对从未施打或曾经施打过PPV23能刺激更高的免疫反应。以下是美国预防接种委员会（US ACIP）针对不同年纪施打肺炎链球菌疫苗的建议：

• 婴幼儿：是以施打PCV13（2剂基础剂加上1剂追加剂），出生满2个月施打第一剂，间隔8周施打第二剂，年满12~15个月施打第三剂。

• 成人：最佳的保护方法是联合使用PPV23和PCV13。

• 65岁以上长者：

  1. 从未施打疫苗的长者则建议接种1剂PCV13然后间隔至少1 年以上后再接种PPV23。

  2. 曾经于65岁后施打PPV23的长者则建议间隔一年后补充施打PCV13。

  3. 在65岁以前就曾接种过PPV23的长者，建议与PPV23间隔1年以上接种PCV13，然后施打间隔至少1 年后补充接种PPV23，但是两剂PPV23 应间隔至少5 年以上。