“被圈住的心灵!”大脑环状RNA调控网路,和自闭症风险基因高度相关
为此,团队进一步预测这些环状RNA的下游调控路径,建构出8,170个环状RNA、微RNA、信使RNA(mRNA)间的交互调控网路 (图二),接着再透过基因富集分析,发现这些网路所调控的下游目标基因,显著集中在已知的自闭症风险基因。
庄树谆研究员说明,这个研究除设计大数据分析流程来建构环状RNA的调控网路关系,也结合分生实验验证。团队挑选一个在自闭症患者脑部表现量明显上升的环状RNA(命名为circARID1A),于人类神经细胞实验验证后发现, circARID1A确实可借由调控微RNA(miR-204-3p),影响下游多个自闭症风险基因的表达 (图三)。
庄树谆研究员团队不仅建构环状RNA的调控网路,论文封面也让人好奇,只见一个孩子孤独地待在自己的星球上,寂寞地望着地球。庄树谆解释,此图片设计灵感来自于以自闭症为主题的纪录片《遥远星球的孩子》,环绕在星球外围的光环即环状RNA,像海绵一样吸附轨道上的小行星,“像上帝画的圈圈”,让自闭症孩子只能待在自己的星球上,难以融入地球常轨。
由于自闭症发生原因不明,本文揭开环状RNA在自闭症脑组织的调控关系,可用以探究自闭症的致病分子机制,对于未来诊断、追踪及治疗提供新的思考方向。研究团队结合信息、统计、分生、演化等知识背景 (图四),所设计的大数据分析与分生实验流程,将来也可应用于与环状RNA调控相关之其他神经疾病上,如:阿兹海默症、帕金森氏症、思觉失调症等。
本论文共同第一作者包括基因体研究中心陈彦如、陈嘉莹、麦德伦博士,通讯作者为庄树谆研究员。