2 2020/5/14 上午 11:52:00

增进对自闭症致病分子机制了解!中研院首建构脑组织环状RNA与基因间调控网路图谱

(關鍵字: 大腦 , 基因 , 自閉症 , 中研院 , RNA

图二、环状RNA调控网路。A图为环状RNA、微RNA、信使RNA间交互调控网路示意图。B图为所预测的其中部分的调控网路,红色字体显示此网路中的12个已知的自闭症风险基因。(图片/中研院提供)
圖二、環狀RNA調控網路。A圖為環狀RNA、微RNA、信使RNA間交互調控網路示意圖。B圖為所預測的其中部分的調控網路,紅色字體顯示此網路中的12個已知的自閉症風險基因。(圖片/中研院提供)

“被圈住的心灵!”大脑环状RNA调控网路,和自闭症风险基因高度相关

为此,团队进一步预测这些环状RNA的下游调控路径,建构出8,170个环状RNA、微RNA、信使RNA(mRNA)间的交互调控网路 (图二),接着再透过基因富集分析,发现这些网路所调控的下游目标基因,显著集中在已知的自闭症风险基因。

庄树谆研究员说明,这个研究除设计大数据分析流程来建构环状RNA的调控网路关系,也结合分生实验验证。团队挑选一个在自闭症患者脑部表现量明显上升的环状RNA(命名为circARID1A),于人类神经细胞实验验证后发现, circARID1A确实可借由调控微RNA(miR-204-3p),影响下游多个自闭症风险基因的表达 (图三)。

图三、在人类神经相关细胞(NHA或ReN cells)实验验证circARID1A确实可借由调控miR-204-3p影响自闭症风险基因(如NLGN1、 STAG1、HSD11B1、VIP、UBA6)的基因表达。(图片/中研院提供)
圖三、在人類神經相關細胞(NHA或ReN cells)實驗驗證circARID1A確實可藉由調控miR-204-3p影響自閉症風險基因(如NLGN1、 STAG1、HSD11B1、VIP、UBA6)的基因表達。(圖片/中研院提供)

庄树谆研究员团队不仅建构环状RNA的调控网路,论文封面也让人好奇,只见一个孩子孤独地待在自己的星球上,寂寞地望着地球。庄树谆解释,此图片设计灵感来自于以自闭症为主题的纪录片《遥远星球的孩子》,环绕在星球外围的光环即环状RNA,像海绵一样吸附轨道上的小行星,“像上帝画的圈圈”,让自闭症孩子只能待在自己的星球上,难以融入地球常轨。

论文封面图片_灵感来自于纪录片《遥远星球的孩子》,因无法融入地球轨道,一个人孤独地待在自己的星球上。(绘图/徐维骏)
論文封面圖片_靈感來自於紀錄片《遙遠星球的孩子》,因無法融入地球軌道,一個人孤獨地待在自己的星球上。(繪圖/徐維駿)

由于自闭症发生原因不明,本文揭开环状RNA在自闭症脑组织的调控关系,可用以探究自闭症的致病分子机制,对于未来诊断、追踪及治疗提供新的思考方向。研究团队结合信息、统计、分生、演化等知识背景 (图四),所设计的大数据分析与分生实验流程,将来也可应用于与环状RNA调控相关之其他神经疾病上,如:阿兹海默症、帕金森氏症、思觉失调症等。

图四、本研究所需的知识背景雷达图。目前该研究团队中有一半是“纯理工”背景,另一半是“纯分子生物”背景,一个理想的生物资讯团队极需要上述两种背景的同仁紧密合作。欢迎具备上述任一背景的同学加入崭新的医疗大数据分析世界。详情请上庄树谆老师实验室网站查询:idv.sinica.edu.tw/trees/。(图片/中研院提供)
圖四、本研究所需的知識背景雷達圖。目前該研究團隊中有一半是「純理工」背景,另一半是「純分子生物」背景,一個理想的生物資訊團隊極需要上述兩種背景的同仁緊密合作。歡迎具備上述任一背景的同學加入嶄新的醫療大數據分析世界。詳情請上莊樹諄老師實驗室網站查詢:idv.sinica.edu.tw/trees/。(圖片/中研院提供)

本论文共同第一作者包括基因体研究中心陈彦如、陈嘉莹、麦德伦博士,通讯作者为庄树谆研究员。

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