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百日咳是一種侵犯呼吸道的急性細菌性疾病，由百日咳桿菌引發，主要從飛沫傳染，好發於五歲以下兒童，其他年齡層亦可能發生，但症狀較輕微或不明顯。

一開始疾病發作只有輕微性咳嗽，被稱為黏膜期。在這之後一到兩週，會成為陣發性咳嗽，且持續一到兩個月或者更久，此時呼吸道分泌物會變多且黏稠，而咳嗽成為突然陣痙性的咳嗽，可以持續2至4週。但一般小於六個月的嬰兒常有的症狀是哽塞窒息、嘔吐、臉部通紅、或眼睛凸起等，成人患者也少見這種典型的陣發性咳嗽。在陣發期出現之前，疾病具有高度的傳染性，之後傳染力才會逐漸降低。隨著陣發性痙咳逐漸減少，氣管、支氣管粘膜上的病菌被消滅，進入恢復期，之後兩到三周即痊癒。在痊癒後的一年內，即使只是得到一般感冒也可能出現劇烈咳嗽，讓人誤以為是百日咳，但其實這只是恢復期特有的現象。

百日咳在幼兒營養狀況不良或併有其他腸道及呼吸道感染時，最容易導致死亡；併發症中以肺炎為主要死因，尤其是六個月以下的嬰兒，除了肺炎之外還可能產生中耳炎、抽搐、腦病變等。百日咳是我們國內必須報告的傳染病之一，主要就是在於它對嬰兒的危害。